RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465158.5

RBM39-225, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 825 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-225	ENST00000465158	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	EDN2	P20800	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	C7orf71	A4D174	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	UBE2C	O00762	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	INS	P01308	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ORM1	P02763	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	APOC4	P55056	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ERCC8	Q13216	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	OR5I1	Q13606	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ODF1	Q14990	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158		Q6ZSN1	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158		V9GYV3	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	SH2D1A	O60880	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	IGLL1	P15814	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158		Q8TAT8	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158		A8MZ25	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158		F6UB75	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	MT-ND6	P03923	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ASIP	P42127	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	CACNG7	P62955	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	RIG	Q13278	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	VWF	P04275	2813 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158		A0A1B0GUT8	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TYMS	P04818	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	CD7	P09564	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	CRIP1	P50238	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ELOB	Q15370	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	FRZB	Q92765	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	CIDEA	O60543	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-225	ENST00000465158	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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