RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RRN3P1Q2M238 152 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01559Q495D7 138 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC21Q5SSG8 566 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SVBPQ8N300 66 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 OR11H2Q8NH07 326 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT11Q96G61 164 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SFRP2Q96HF1 295 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 B9D2Q9BPU9 175 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ZMAT4Q9H898 229 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 APOC3P02656 99 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 MT-ND4LP03901 98 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCL1P09341 107 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 HTN1P15515 57 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZQT7 251 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.81□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MWL6 223 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SNAPINO95295 136 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 MIFP14174 115 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ASIPP42127 132 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RHEBQ15382 184 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 CT83Q5H943 113 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf74Q96GX8 76 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 X6R8D5 127 aa6.8□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 GNRH2O43555 120 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TYMSP04818 313 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF415Q09FC8 603 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF212Q495C1 297 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 DNLZQ5SXM8 178 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PPQ1 181 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM231BA6NCW3 169 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SNURFLB1AK76 121 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 MED14OSP0DP75 135 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 AZU1P20160 251 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TSKUQ8WUA8 353 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SPXQ9BT56 116 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RETNQ9HD89 108 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 V9GYV3 84 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WWC5 75 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 F2Z2F3 143 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 PRM2P04554 102 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A1P23297 94 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 TCL1AP56279 114 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 IL36BQ9NZH7 164 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 MDFICQ9P1T7 246 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BVH4 76 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5AL1P0C617 328 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 GZMBP10144 247 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF575Q86XF7 245 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8NAQ8 132 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf85Q96MD7 179 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 IMMP2LQ96T52 175 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 LYRM9A8MSI8 78 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 HIGD1CA8MV81 97 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R2P5 195 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms