RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 M0R381 172 aa15.54■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 OVOL1O14753 267 aa15.54■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 TRAV21A0A0B4J279 112 aa15.53■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 H3BUA1 57 aa15.53■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 LAGE3Q14657 143 aa15.53■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 F6UB75 175 aa15.53■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 MSMBP08118 114 aa15.53■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 IGKCP01834 107 aa15.52■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
IMP4-208ENST00000460766 SIVA1O15304 175 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 HSD52Q0P140 79 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 TM4SF20Q53R12 229 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 ZMAT4Q9H898 229 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 HHLA3Q9XRX5 114 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 ATP5LO75964 103 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa15.51■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 PRSS47A8MTI9 375 aa15.5■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.5■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 A6NDN8 102 aa15.5■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 BRI3O95415 125 aa15.5■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 ASIPP42127 132 aa15.5■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 MRAP2Q96G30 205 aa15.5■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 A0A0G2JLM5 398 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 K7EP13 123 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 DPM2O94777 84 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 SRD5A1P18405 259 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 KIR3DS1Q14943 382 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.49■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.48■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 TMEM160Q9NX00 188 aa15.48■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.48■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.48■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.48■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 SMPXQ9UHP9 88 aa15.48■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 AVPP01185 164 aa15.47■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 IGLV1-40P01703 118 aa15.47■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 SMIM2Q9BVW6 85 aa15.47■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.46■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 PSMG4Q5JS54 123 aa15.46■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 AP1S3Q96PC3 154 aa15.46■□□□□ 0.07
IMP4-208ENST00000460766 GNRH2O43555 120 aa15.46■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 EDN2P20800 178 aa15.46■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 FAM19A4Q96LR4 140 aa15.46■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.46■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 SPG11Q96JI7 2443 aa15.45■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 H3BRM9 83 aa15.45■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 MGPP08493 103 aa15.45■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 B4DSR2 109 aa15.44■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 RASL10AQ92737 203 aa15.44■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.44■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.44■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 RAB37Q96AX2 223 aa15.43■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 C9orf118A6NHY6 69 aa15.43■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 NRGNQ92686 78 aa15.43■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 SPOCK3Q9BQ16 436 aa15.43■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 H3BUT2 72 aa15.42■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 CFHR3Q02985 330 aa15.42■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 A0A087WX48 190 aa15.42■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 GAGE10A6NGK3 116 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 GCSHP23434 173 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 WFDC12Q8WWY7 111 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 RBX1P62877 108 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 ORMDL2Q53FV1 153 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 JMJD8Q96S16 334 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.41■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 C20orf78Q9BR46 151 aa15.4■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.4■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 MED14OSP0DP75 135 aa15.4■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 SCGB3A1Q96QR1 104 aa15.4■□□□□ 0.06
IMP4-208ENST00000460766 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa15.39■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 GAGE12BA1L429 117 aa15.39■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 IGHV4-59P01825 116 aa15.39■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 CST9LQ9H4G1 147 aa15.39■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 HIGD1BQ9P298 99 aa15.39■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 PLNP26678 52 aa15.39■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 ID1P41134 155 aa15.39■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.38■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.38■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 K7EMT4 169 aa15.38■□□□□ 0.05
IMP4-208ENST00000460766 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.38■□□□□ 0.05
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