RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459963.5

NCSTN-209, Transcript of nicastrin, human

TSL 5

Gene NCSTN, Length 1,246 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCSTN-209	ENST00000459963	TRGV9	Q99603	122 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963		U3KQ87	197 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963		V9GYH0	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	WRB	O00258	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	MPDU1	O75352	247 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	TCRB	P04435	133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	ELOB	Q15370	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963		A0A0B4J2A0	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	CENPX	A8MT69	81 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963		H3BRN7	92 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	IFNA7	P01567	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	UBE2D1	P51668	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	IL18	Q14116	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963		A0A087X0K7	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	KLLN	B2CW77	178 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	CTDSPL	O15194	276 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	PTTG1	O95997	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	HOXB5	P09067	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	OR5G3	P0C626	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	RAB11A	P62491	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	COX6A2	Q02221	97 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	RHOH	Q15669	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	PRRT1	Q99946	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	SLC17A3	O00476	420 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	IL5	P05113	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	LINC00869	P0C866	280 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	IL7	P13232	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	S100A7	P31151	101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	INPP1	P49441	399 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	ZNF138	P52744	262 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	AP3S2	P59780	193 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	GUK1	Q16774	197 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCSTN-209	ENST00000459963		A0A087WWC5	75 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963		A0A087WX48	190 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	PGP	A6NDG6	321 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	HYPM	O75409	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	BCAP31	P51572	246 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	OPCML	Q14982	345 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	BAK1	Q16611	211 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	SPX	Q9BT56	116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCSTN-209	ENST00000459963	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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