RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMED6Q8WW62 240 aa5.7□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.7□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.7□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.7□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 A6NHS1 94 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 F6UZH7 168 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERVFC1-1P60608 527 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB2AP61019 212 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNG5P63218 68 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 KHDC3LQ587J8 217 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPXQ9BT56 116 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 OTORQ9NRC9 128 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 MBD2Q9UBB5 411 aa5.69□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGPA6NDG6 321 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRIP30626 198 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSN1S1P47710 185 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 HYLS1Q96M11 299 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.68□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0R2P5 195 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV2-11P01706 119 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORM1P02763 201 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCE3BQ5TA77 95 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 NFE4Q86UQ8 179 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SGK494Q96LW2 274 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAGKQ9UJ70 344 aa5.67□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPM2AB3EWF7 344 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9JCJ5 164 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAG3L2P0CL84 134 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAG3L3P0CL85 134 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIRAPP58753 221 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAS2R45P59539 299 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q5VSD8 79 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf85Q96MD7 179 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TREM1Q9NP99 234 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.66□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7EP13 123 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 RS1O15537 224 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSNA1O43805 119 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFNA5P01569 189 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A6P06703 90 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYGDP07320 174 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAMPP81172 84 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.65□□□□□ -1.5
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 GGTLC3B5MD39 225 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 EREGO14944 169 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCRAP04437 139 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 PET100P0DJ07 73 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00694P0DN24 101 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 EVI2AP22794 236 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 WFDC2Q14508 124 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZSN1 163 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB13Q8WXK3 278 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNS1Q96KK3 526 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q9UF83 564 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALG5Q9Y673 324 aa5.64□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.63□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.63□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PPV4 95 aa5.63□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCGP01275 180 aa5.63□□□□□ -1.51
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