RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AKR1C3P42330 323 aa7.8□□□□□ -1.16
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8N3U1 123 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.8□□□□□ -1.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRO0255Q9UI72 69 aa7.8□□□□□ -1.16
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1B0GV50 99 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRYBA4P53673 196 aa7.79□□□□□ -1.16
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