RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 F2Z2F3 143 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSPOP30536 169 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 LEPP41159 167 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 PYY3Q5JQD4 70 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSMG4Q5JS54 123 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8TAT8 98 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPX1P07203 203 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF688P0C7X2 276 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLAQ13239 276 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 BAGE3Q86Y29 109 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNFNQ9BYD5 112 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSTD3H0UI37 97 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERF1AO75920 110 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLC6P0CF74 106 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DRB4P13762 266 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRIP30626 198 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTRLP40313 264 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TFPI2P48307 235 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 CAMPP49913 170 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 PKIAP61925 76 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 F6UB75 175 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BMM0 161 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ORM1P02763 201 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 PF4P02776 101 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 MED14OSP0DP75 135 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDKN1BP46527 198 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00310P59036 64 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TDRG1Q3Y452 100 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCNS1Q96KK3 526 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF747Q9BV97 191 aa6.86□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SAP30O75446 220 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5AL1P0C617 328 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB131AP59861 70 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMTNQ6UX39 209 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 F8P00451 2351 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNAI2O43623 268 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 GZMBP10144 247 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB4AP20338 218 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 IQCJQ1A5X6 159 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 C7orf71A4D174 169 aa6.84□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR11H12B2RN74 326 aa6.84□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUPR1O60356 82 aa6.84□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 PMCHP20382 165 aa6.84□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.84□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.84□□□□□ -1.31
CCNDBP1-202ENST00000444658 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.84□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB1P60022 68 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 CACNG7P62955 275 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF124Q15973 351 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR9Q5T870 116 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.83□□□□□ -1.32
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