RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 HLA-DMBP28068 263 aa11.49□□□□□ -0.57
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PTPRU-204ENST00000428026 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
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PTPRU-204ENST00000428026 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 RNF114Q9Y508 228 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 POU2AF1Q16633 256 aa11.38□□□□□ -0.59
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PTPRU-204ENST00000428026 Q9H8V8 135 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRU-204ENST00000428026 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.38□□□□□ -0.59
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