RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 INSL3P51460 131 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2D3P61077 147 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2D2P62837 147 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ASCL5Q7RTU5 278 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NBL1P41271 181 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 GLMPQ8WWB7 406 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA25Q9BR10 227 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 THYN1Q9P016 225 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R1W7 72 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 KLRD1Q13241 179 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4X2Q8NGF9 303 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf173Q96LM9 149 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF24Q9Y225 148 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGIPA6NJ69 53 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLL5B9A064 214 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF152Q8N8N0 203 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8N8P6 123 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CDIP1Q9H305 208 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 BAHCC1Q9P281 2608 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 KLLNB2CW77 178 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TOX4O94842 621 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RIGQ13278 110 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM11P17152 192 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL7P18124 248 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BUT2 72 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NFE4Q86UQ8 179 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF580Q9UK33 172 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HILPDAQ9Y5L2 63 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 K7ERJ3 54 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CFHR3Q02985 330 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM2Q9BVW6 85 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MTW9 85 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 K7EMI3 77 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF182Q8N6D2 247 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRD5 423 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRF3 423 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRM7 423 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 G3V318 75 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 K7ERU9 68 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHG2P01859 326 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMG4Q5JS54 123 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 WFDC12Q8WWY7 111 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LITAFQ99732 161 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 K7ENP7 123 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 COX7A1P24310 79 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB1P60022 68 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C15orf32Q32M92 178 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.71□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 P0DMU3 169 aa2.71□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM231AP0DMU4 169 aa2.71□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM231CP0DMU5 169 aa2.71□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ERCC8Q13216 396 aa2.71□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ARPC1AQ92747 370 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 RPEQ96AT9 228 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A096LNT2 108 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V0E1O15342 81 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 WFDC2Q14508 124 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 VAMP3Q15836 100 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 A1L4Q6 167 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 EFNA4P52798 201 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 MEGF9Q9H1U4 602 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFHX3Q15911 3703 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 TAL2Q16559 108 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 MINOS1Q5TGZ0 78 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01560Q8TB33 94 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 COL6A5A8TX70 2615 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WX48 190 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC3BP05452 202 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 AMTNQ6UX39 209 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 MFAP4P55083 255 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 RRN3P1Q2M238 152 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 ONECUT1Q9UBC0 465 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 RPH3ALQ9UNE2 315 aa2.71□□□□□ -1.98
PGGT1B-203ENST00000419445 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.5 ms