RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV3-53P01767 116 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HOXA5P20719 270 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FHITP49789 147 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UBE2G1P62253 170 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLAQ13239 276 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TDRG1Q3Y452 100 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C8orf49Q96NF6 230 aa8.7□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A1B0GV50 99 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BNG1 76 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TEX46H3BTG2 121 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNRH2O43555 120 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q6ZNX1 250 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC00479Q96M42 142 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.69□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MUC4Q99102 2169 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 M0R2P5 195 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAX4O43316 350 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGLV2-11P01706 119 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TYMSP04818 313 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AKAP14Q86UN6 197 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FMC1Q96HJ9 113 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NACAE9PAV3 2078 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAGE4O60829 102 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1QBP02746 253 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AKR1C3P42330 323 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB5CP51148 216 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RASL10AQ92737 203 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRO0255Q9UI72 69 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q86TA4 180 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9JCJ5 164 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ORM1P02763 201 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC51BQ86UW2 128 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.65□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SFTA3P0C7M3 94 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CRYBA4P53673 196 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FHL2Q14192 279 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF876PQ49A33 203 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MANBALQ9NQG1 85 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A096LPF7 62 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B4DEV8 164 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ASIPP42127 132 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ESRGQ1W209 222 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF479Q96JC4 524 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q9H8V8 135 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNG13Q9P2W3 67 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CIDEAO60543 219 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFNA1P01562 189 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SRIP30626 198 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SULT1A2P50226 295 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 M0R036 132 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SH2D1AO60880 128 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LTAP01374 205 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GYPEP15421 78 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTC32Q5I0X7 151 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 Q6ZR54 194 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BAGE2Q86Y30 109 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYT8Q8NBV8 401 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTH2Q96A98 100 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms