RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-203ENST00000402697 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-203ENST00000402697 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-203ENST00000402697 A1L4Q6 167 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-203ENST00000402697 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-203ENST00000402697 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-203ENST00000402697 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.91□□□□□ -0.82
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PRAME-203ENST00000402697 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 PLNP26678 52 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 PRR9Q5T870 116 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 AP1S3Q96PC3 154 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 KLK15Q9H2R5 256 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-203ENST00000402697 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 BLCAPP62952 87 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-203ENST00000402697 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-203ENST00000402697 FXYD7P58549 80 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-203ENST00000402697 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 TM4SF20Q53R12 229 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 C18orf15Q96N68 181 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-203ENST00000402697 APCP25054 2843 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 C7orf71A4D174 169 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-203ENST00000402697 IGHV3-11P01762 117 aa9.83□□□□□ -0.84
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