RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 LEPP41159 167 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 GFRA4Q9GZZ7 299 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 KIR3DS1Q14943 382 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 FAM210BQ96KR6 192 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PPQ1 181 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 SBSPONQ8IVN8 264 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHS1-201ENST00000368547 UBE2CO00762 179 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 CRXO43186 299 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 AMBPP02760 352 aa21.57■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 TYMSP04818 313 aa21.57■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 OR2D3Q8NGH3 330 aa21.57■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 KLLNB2CW77 178 aa21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 GPX1P07203 203 aa21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 NAT8BQ9UHF3 227 aa21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 RPL19P84098 196 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB135Q30KP9 77 aa21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 PRR9Q5T870 116 aa21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 GFI1BQ5VTD9 330 aa21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa21.55■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 XKRY2A2RUG3 117 aa21.54■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 RPS20P60866 119 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 NEU1Q99519 415 aa21.54■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 INSP01308 110 aa21.53■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01559Q495D7 138 aa21.53■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZWC4 215 aa21.53■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 B9D2Q9BPU9 175 aa21.53■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM189A5PLL7 270 aa21.52■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ECHS1-201ENST00000368547 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa21.51■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 Q6AWC8 147 aa21.51■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa21.51■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV21A0A0B4J279 112 aa21.51■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 C7orf71A4D174 169 aa21.51■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 TCL1AP56279 114 aa21.51■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 HIGD1CA8MV81 97 aa21.5■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RBMY1CP0DJD4 496 aa21.5■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 NUP35Q8NFH5 326 aa21.5■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 GTSF1Q8WW33 167 aa21.5■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RCHY1Q96PM5 261 aa21.5■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RPS10P46783 165 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf158Q8N1D5 194 aa21.48■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RNF183Q96D59 192 aa21.48■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RETNQ9HD89 108 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 ORM1P02763 201 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 COX19Q49B96 90 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 RASL11AQ6T310 242 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZQT7 251 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 TM2D3Q9BRN9 247 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa21.47■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 SPRY2O43597 315 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM208Q9BTX3 173 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 C20orf144Q9BQM9 153 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA25Q9BR10 227 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 OVOL2Q9BRP0 275 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 GZMBP10144 247 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF575Q86XF7 245 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf21Q9P2W6 132 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM256Q8N2U0 113 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01587Q99440 93 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf196B1AJZ1 125 aa21.41■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 OR11H2Q8NH07 326 aa21.41■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 IGLC6P0CF74 106 aa21.4■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 WDR73Q6P4I2 378 aa21.4■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 PGLYRP4Q96LB8 373 aa21.4■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 GNB1LQ9BYB4 327 aa21.4■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa21.4■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 ZMAT4Q9H898 229 aa21.4■■□□□ 1.02
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GXF2 115 aa21.39■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 CTRLP40313 264 aa21.39■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 X6R8D5 127 aa21.39■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 MT-ND6P03923 174 aa21.38■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 PRM2P04554 102 aa21.38■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 HTN1P15515 57 aa21.38■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa21.38■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 COL7A1Q02388 2944 aa21.38■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 SPINK4O60575 86 aa21.37■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 MUC21Q5SSG8 566 aa21.37■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 DNAH9Q9NYC9 4486 aa21.37■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GUT8 65 aa21.37■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GW15 77 aa21.37■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 TRGC2P03986 189 aa21.37■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 RAB5BP61020 215 aa21.37■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 NAGKQ9UJ70 344 aa21.37■■□□□ 1.01
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