RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 GGNQ86UU5 652 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 CD177Q8N6Q3 437 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM219Q86XT9 240 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 IMUPQ9GZP8 106 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 PSCAO43653 123 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 DKK2Q9UBU2 259 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 LMO1P25800 156 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 FAM201AQ5SY85 155 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZRM9 215 aa6.59□□□□□ -1.35
PKHD1-201ENST00000340994 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.59□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 STPG1Q5TH74 334 aa6.59□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF726P1Q15940 193 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PCP2Q8IVA1 136 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFB1O75438 58 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 LGALS9O00182 355 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1-16P04430 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PFN2P35080 140 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 LTBP1Q14766 1721 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 GATA3P23771 443 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C20orf173Q96LM9 149 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.58□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 GAFA1Q96PS6 74 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 Q8TCH9 128 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFA4O00483 81 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 FAM236CP0DP71 79 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PROP1O75360 226 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 Q9H8V8 135 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 K7EN84 100 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 SAP30O75446 220 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFA7O95182 113 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 LINC01560Q8TB33 94 aa6.57□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00311Q8N616 119 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 FAM27E3Q08E93 113 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 RNF114Q9Y508 228 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PTPRSQ13332 1948 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 E9PLN8 166 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PTH2Q96A98 100 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 SEC61GP60059 68 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 NDPQ00604 133 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0G2JRQ6 117 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 ADAMTS20P59510 1910 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 CRYGCP07315 174 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 NREPQ16612 68 aa6.56□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 DKK1O94907 266 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 U3KQE9 123 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PRR15LQ9BU68 103 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFS5O43920 106 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 H3BUA1 57 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 BAALCQ8WXS3 180 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 VOPP1Q96AW1 172 aa6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf63A6NC05 138 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 EFNA4P52798 201 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 PATE3B3GLJ2 98 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf86A6NJI1 115 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 CD59P13987 128 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 WFDC2Q14508 124 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 E9PLD3 99 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 TIMM17AQ99595 171 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 A4D1N5 150 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 B4DSR2 109 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 Q8N1Y9 231 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 FXYD2P54710 66 aa6.54□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 CTRLP40313 264 aa6.54□□□□□ -1.36
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