RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 JMJD8Q96S16 334 aa9.3□□□□□ -0.92
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ZNF548-201ENST00000336128 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.29□□□□□ -0.92
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ZNF548-201ENST00000336128 NIT1Q86X76 327 aa9.29□□□□□ -0.92
ZNF548-201ENST00000336128 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.29□□□□□ -0.92
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ZNF548-201ENST00000336128 C3orf79P0CE67 100 aa9.22□□□□□ -0.93
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ZNF548-201ENST00000336128 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.22□□□□□ -0.93
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ZNF548-201ENST00000336128 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.22□□□□□ -0.93
ZNF548-201ENST00000336128 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.22□□□□□ -0.93
ZNF548-201ENST00000336128 H3BMM0 161 aa9.22□□□□□ -0.93
ZNF548-201ENST00000336128 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
ZNF548-201ENST00000336128 Q8N976 141 aa9.22□□□□□ -0.93
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
ZNF548-201ENST00000336128 HIVEP2P31629 2446 aa9.21□□□□□ -0.93
ZNF548-201ENST00000336128 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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