RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 FAM210BQ96KR6 192 aa15.68■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa15.67■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 LY6G6CO95867 125 aa15.67■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 PFN1P07737 140 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 CRIP1P50238 77 aa15.67■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 PPT1P50897 306 aa15.67■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 ALKAL2Q6UX46 152 aa15.67■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 NAGKQ9UJ70 344 aa15.67■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 SCO2A0A1W2PP80 73 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 TYMSP04818 313 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 FMC1Q96HJ9 113 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 C18orf15Q96N68 181 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAF3Q9BU61 184 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 GNG13Q9P2W3 67 aa15.66■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 LTAP01374 205 aa15.65■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 HOXA5P20719 270 aa15.65■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF415Q09FC8 603 aa15.65■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.65■□□□□ 0.1
SYF2-201ENST00000236273 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 F5H768 121 aa15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 LGALS9BQ3B8N2 356 aa15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 MANBALQ9NQG1 85 aa15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 MUC4Q99102 2169 aa15.64■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 ZNF575Q86XF7 245 aa15.63■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa15.62■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 AKR1C3P42330 323 aa15.62■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 UBE2G1P62253 170 aa15.62■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 KCNS1Q96KK3 526 aa15.62■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.62■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 RASL10AQ92737 203 aa15.61■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 C11orf52Q96A22 123 aa15.61■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 SPXQ9BT56 116 aa15.61■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 DNAH6Q9C0G6 4158 aa15.61■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.6■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 TEX46H3BTG2 121 aa15.6■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 LYPD6BQ8NI32 183 aa15.6■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 MLST8Q9BVC4 326 aa15.6■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.59■□□□□ 0.09
SYF2-201ENST00000236273 TRGV2A0A075B6R0 118 aa15.58■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 S100A9P06702 114 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.58■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC17Q9BRA2 123 aa15.58■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 DERL1Q9BUN8 251 aa15.58■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 SH2D1AO60880 128 aa15.57■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 BCL2P10415 239 aa15.57■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 OR5I1Q13606 314 aa15.57■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 NHLRC2Q8NBF2 726 aa15.57■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 C9orf85Q96MD7 179 aa15.57■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 M0R2P5 195 aa15.56■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 BLOC1S1P78537 153 aa15.56■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.56■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.55■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 RPL35P42766 123 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.55■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 BAGE2Q86Y30 109 aa15.55■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.55■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.54■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-53P01767 116 aa15.54■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 FHL2Q14192 279 aa15.54■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 VAX2Q9UIW0 290 aa15.54■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 NACAE9PAV3 2078 aa15.54■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 A0A0J9YY99 117 aa15.53■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 IFNA1P01562 189 aa15.53■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 IGLV2-8P01709 118 aa15.53■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 ZNF479Q96JC4 524 aa15.53■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 ORM1P02763 201 aa15.52■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 SFTA3P0C7M3 94 aa15.52■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 P0DMU3 169 aa15.52■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 FAM231AP0DMU4 169 aa15.52■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 FAM231CP0DMU5 169 aa15.52■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 LINC01559Q495D7 138 aa15.52■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 DNLZQ5SXM8 178 aa15.52■□□□□ 0.08
SYF2-201ENST00000236273 DNAH10Q8IVF4 4471 aa15.51■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 PGPEP1LA6NFU8 196 aa15.51■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 B4DEV8 164 aa15.51■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 H3BNG1 76 aa15.51■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 M0R036 132 aa15.51■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 PDE6DO43924 150 aa15.51■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 PTH2Q96A98 100 aa15.51■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 RAB19A4D1S5 217 aa15.5■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 NUDT3O95989 172 aa15.5■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa15.49■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 ZNF876PQ49A33 203 aa15.49■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 DNAH2Q9P225 4427 aa15.49■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 TRAV4A0A0B4J268 109 aa15.48■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.48■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 C9JCJ5 164 aa15.48■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 CRYBA4P53673 196 aa15.48■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 RNF212Q495C1 297 aa15.48■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 CENPWQ5EE01 88 aa15.48■□□□□ 0.07
SYF2-201ENST00000236273 MED9Q9NWA0 146 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms