RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 CD33P20138 364 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 ERG28Q9UKR5 140 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 OVOL3O00110 214 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 DLEU1O43261 78 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 IGLC2P0DOY2 106 aa4.98□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 KLRD1Q13241 179 aa4.98□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.97□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.97□□□□□ -1.61
SETX-201ENST00000224140 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.97□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.97□□□□□ -1.61
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SETX-201ENST00000224140 TMEM219Q86XT9 240 aa4.96□□□□□ -1.62
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SETX-201ENST00000224140 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.95□□□□□ -1.62
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SETX-201ENST00000224140 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.95□□□□□ -1.62
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SETX-201ENST00000224140 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.94□□□□□ -1.62
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SETX-201ENST00000224140 HIGD1BQ9P298 99 aa4.93□□□□□ -1.62
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