RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SPINK8	P0C7L1	97 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	FOXI1	Q12951	378 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	IGKC	P01834	107 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	TWIST1	Q15672	202 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GWB2	263 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659		K7ERJ3	54 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	UBE2E1	P51965	193 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	ORM2	P19652	201 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	PLGLA	Q15195	96 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	NPB	Q8NG41	125 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	NBR2	O15453	112 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	ODF1	Q14990	250 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	DPM2	O94777	84 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFA3	O95167	84 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	CRYGC	P07315	174 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	HES1	Q14469	280 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	GAGE5	Q13069	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	GAGE6	Q13070	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	CDIP1	Q9H305	208 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	TACC2	O95359	2948 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	TEX22	C9J3V5	150 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	FCER1G	P30273	86 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	TCTA	P57738	103 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	DSCR9	P59020	149 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZUT4	128 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	NRGN	Q92686	78 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	EBI3	Q14213	229 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	COL12A1	Q99715	3063 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659	CNIH1	O95406	144 aa		11.9	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	CKS2	P33552	79 aa		11.9	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659		Q8N6K4	173 aa		11.9	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.9	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	C20orf78	Q9BR46	151 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	NPFF	O15130	113 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	APELA	P0DMC3	54 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	SAA4	P35542	130 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS1	P07477	247 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	HIST1H4G	Q99525	98 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	NPY	P01303	97 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	IL4	P05112	153 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A16	P16260	332 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	PLN	P26678	52 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-225	ENST00000630659	INSL3	P51460	131 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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