RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	NXPH4	O95158	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF138	P52744	262 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	TTC32	Q5I0X7	151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	PAX4	O43316	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	PRAF2	O60831	178 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	CRYBA4	P53673	196 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP5S	Q99766	215 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	S100Z	Q8WXG8	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	SIVA1	O15304	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	MPC2	O95563	127 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF266	Q14584	549 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	TVP23C	Q96ET8	276 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1W2PPQ1	181 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	NMB	P08949	121 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	GNG5	P63218	68 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF415	Q09FC8	603 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201		A6NHS1	94 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201		F6UZH7	168 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	GNRH2	O43555	120 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB2A	P61019	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201		Q6AWC8	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201		Q8N1X5	172 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FCHO1-231	ENST00000600201	HERC1	Q15751	4861 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201		K7EQD1	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	SSNA1	O43805	119 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	PGP	A6NDG6	321 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	TYMS	P04818	313 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	GYPE	P15421	78 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	CSN1S1	P47710	185 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		10.05	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	IFNA5	P01569	189 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	RASL10A	Q92737	203 aa		10.04	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	XG	P55808	180 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP10-1	P60331	282 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	HAMP	P81172	84 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	MYCBP2	O75592	4640 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FCHO1-231	ENST00000600201	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A087WTM6	91 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201	SRI	P30626	198 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201	TAS2R45	P59539	299 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201	TDRG1	Q3Y452	100 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FCHO1-231	ENST00000600201	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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