RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559		Q8N8P6	123 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-69	P01742	117 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	LY6D	Q14210	128 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM219	Q86XT9	240 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559		A1L4Q6	167 aa		14.1	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SNAI2	O43623	268 aa		14.1	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	TRGV3	P03979	118 aa		14.1	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		14.1	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	GLMP	Q8WWB7	406 aa		14.1	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP6	Q13023	2319 aa		14.1	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS47	A8MTI9	375 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	ARL3	P36405	182 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	SMPX	Q9UHP9	88 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559		A6NDN8	102 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	CBY3	A6NI87	242 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-39	P01824	125 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RRN3-205	ENST00000563559	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	BRI3	O95415	125 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	EVI2A	P22794	236 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	HSD52	Q0P140	79 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	C18orf15	Q96N68	181 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf71	A4D174	169 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA4	O00483	81 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5L	O75964	103 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	GAS8-AS1	O95177	125 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IGF1	P05019	195 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00477	Q96M19	166 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZMAT4	Q9H898	229 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DKK2	Q9UBU2	259 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559		H3BUA1	57 aa		14.07	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS1	P07477	247 aa		14.07	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	USMG5	Q96IX5	58 aa		14.07	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		14.07	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ODF1	Q14990	250 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf84	I3L1E1	186 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OVOL1	O14753	267 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FOXE3	Q13461	319 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	14.05	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NMU	P48645	174 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PRORY	Q9H606	182 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	LAGE3	Q14657	143 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	MRAP2	Q96G30	205 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		14.04	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		14.04	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NRAC	Q8N912	160 aa		14.04	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		14.04	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559		H3BRM9	83 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IGKC	P01834	107 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM17	P0DL12	118 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ERAS	Q7Z444	233 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ITPR1	Q14643	2758 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFS8	O00217	210 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DPM2	O94777	84 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	AP1S3	Q96PC3	154 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IGHG2	P01859	326 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	GNLY	P22749	145 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	UQCRFS1	P47985	274 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PCP2	Q8IVA1	136 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf173	Q96LM9	149 aa		14.02	□□□□□ -0.16
RRN3-205	ENST00000563559		H3BVH4	76 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	FOXC2	Q99958	501 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HIGD1B	Q9P298	99 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf118	A6NHY6	69 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SOCS3	O14543	225 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TCTA	P57738	103 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	KIR3DS1	Q14943	382 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PRR9	Q5T870	116 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GPHB5	Q86YW7	130 aa		14	□□□□□ -0.17

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