RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 AMN1Q8IY45 258 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF525Q8N782 197 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 C17orf77Q96MU5 243 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 CENPFP49454 3210 aa4.16□□□□□ -1.74
CAPN3-211ENST00000562199 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0J9YXV3 536 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 E9PLD3 99 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 COX7A2LO14548 114 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNHIT1O43257 154 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 HLA-DQA1P01909 254 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SMIM13P0DJ93 91 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ERVK-16P61578 105 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 HBBP68871 147 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FAM27BQ5VT28 67 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 PCSK4Q6UW60 755 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 PRNTQ86SH4 94 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF329Q86UD4 541 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 OR8B3Q8NGG8 313 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MANBALQ9NQG1 85 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SPRR3Q9UBC9 169 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 XCL2Q9UBD3 114 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 HCFC1P51610 2035 aa4.15□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 UTRNP46939 3433 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0G2JRQ6 117 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 K7EM74 188 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ATOX1O00244 68 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MPV17P39210 176 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 Q6ZQT7 251 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CEND1Q8N111 149 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TIMM17AQ99595 171 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 THADAQ6YHU6 1953 aa4.14□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 hADV29S1A0JD25 119 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 LINC01565O15544 149 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 NUPR1O60356 82 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGHV3-9P01782 118 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CSN1S1P47710 185 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FGF12P61328 243 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MORN5Q5VZ52 161 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 NFE4Q86UQ8 179 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 PSENENQ9NZ42 101 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CEP350Q5VT06 3117 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CACNA1CQ13936 2221 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGKV1D-33P01593 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGKV1-33P01594 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGKV1-39P01597 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGKV1D-39P04432 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 C3orf79P0CE67 100 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IAPPP10997 89 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF32P17041 273 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 GNLYP22749 145 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 PCBD1P61457 104 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms