RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.44□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 RNF183Q96D59 192 aa6.44□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 LINC01587Q99440 93 aa6.44□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.44□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 SPATA25Q9BR10 227 aa6.44□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.44□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.44□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 C7orf71A4D174 169 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 KLLNB2CW77 178 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 DEFB135Q30KP9 77 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TVP23CQ96ET8 276 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.43□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 SORL1Q92673 2214 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 ZNF727A8MUV8 499 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 H7BYZ3 331 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 LTAP01374 205 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 GNG4P50150 75 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 KIR3DS1Q14943 382 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 Q86TA4 180 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 OR11H2Q8NH07 326 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 C8orf49Q96NF6 230 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 DERL1Q9BUN8 251 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 PARLQ9H300 379 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 BIN3Q9NQY0 253 aa6.42□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 LINC00862A6NCI5 91 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 GCGP01275 180 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 HTN1P15515 57 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 BTN1A1Q13410 526 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 RRN3P1Q2M238 152 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 CENPWQ5EE01 88 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 Q6AWC8 147 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 UQCC3Q6UW78 93 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 SMIM12Q96EX1 92 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 NEU1Q99519 415 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.41□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 DNHD1Q96M86 4753 aa6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 C9JCJ5 164 aa6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 C9JQL5 133 aa6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 COMMD7Q86VX2 200 aa6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 MLST8Q9BVC4 326 aa6.4□□□□□ -1.38
APH1B-210ENST00000560890 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 CBY3A6NI87 242 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 MIFP14174 115 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 CRIP1P50238 77 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 PRR9Q5T870 116 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 OCC1Q8TAD7 63 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 KCNS1Q96KK3 526 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 RETNQ9HD89 108 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 NAGKQ9UJ70 344 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.39□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 TMEM189A5PLL7 270 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 IGLV2-8P01709 118 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 ORM1P02763 201 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 MUC21Q5SSG8 566 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 PRR27Q6MZM9 219 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 NAT8Q9UHE5 227 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 X6R8D5 127 aa6.38□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 VWFP04275 2813 aa6.37□□□□□ -1.39
APH1B-210ENST00000560890 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms