RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 NUDT15Q9NV35 164 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 RNF24Q9Y225 148 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 K7EPK0 472 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 M0R3E3 92 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 RGS13O14921 159 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLV2-8P01709 118 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 GPX1P07203 203 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 SRPXP78539 464 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 OPCMLQ14982 345 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00477Q96M19 166 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 TM2D2Q9BX73 214 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 C9JCJ5 164 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4E1P0C645 316 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 CRISP2P16562 243 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 BTCP35070 178 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 TDRG1Q3Y452 100 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 BAALCQ8WXS3 180 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 RASL10AQ92737 203 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 SSNA1O43805 119 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLV2-11P01706 119 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 PET100P0DJ07 73 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 LAGE3Q14657 143 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 Q8N3U1 123 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 PSENENQ9NZ42 101 aa5.83□□□□□ -1.48
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RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 HMSDA8MTL9 139 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 GOSR2O14653 212 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 AGPAT2O15120 278 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 NMBP08949 121 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 PPT1P50897 306 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 ID3Q02535 119 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 GUK1Q16774 197 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGGTA-217ENST00000560521 FNDC10F2Z333 226 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 COX7A2P2O60397 106 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF253O75346 499 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 NDUFB4O95168 129 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 HOXB5P09067 269 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 MUC21Q5SSG8 566 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM210AQ96ND0 272 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 MGST2Q99735 147 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 SPXQ9BT56 116 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 ARL16Q0P5N6 197 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 LELP1Q5T871 98 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 Q6ZRU5 148 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF546Q86UE3 836 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 Q8N976 141 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 SMIM8Q96KF7 97 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF492Q9P255 531 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 SSSCA1O60232 199 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 VAMP1P23763 118 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF345Q14585 488 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 ODF1Q14990 250 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTA-217ENST00000560521 MITD1Q8WV92 249 aa5.79□□□□□ -1.48
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