RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557695.1

HECTD1-218, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD1, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1-218ENST00000557695 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 C1orf140Q5VVS0 124 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 CASC2Q6XLA1 102 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 NEK7Q8TDX7 302 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 AP3S1Q92572 193 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 CHMP6Q96FZ7 201 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 BTF3L4Q96K17 158 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 TEX37Q96LM6 180 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 IMUPQ9GZP8 106 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 MED11Q9P086 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 NAT8BQ9UHF3 227 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 DNAH5Q8TE73 4624 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 WDR97A6NE52 1622 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 ACANP16112 2415 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
HECTD1-218ENST00000557695 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 VWFP04275 2813 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 TENM4Q6N022 2769 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 PPP5D1E7EU14 171 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 M0R129 80 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 HIST1H2BKO60814 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 CST7O76096 145 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 IFNA1P01562 189 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 FABP4P15090 132 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 SPA17Q15506 151 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 SPATA45Q537H7 98 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 STX12Q86Y82 276 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 ATOH7Q8N100 152 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 OR13C6PQ8NH95 151 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 LINC00467Q9BRT7 94 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 CST11Q9H112 138 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 SSR3Q9UNL2 185 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 FLNCQ14315 2725 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 MUC17Q685J3 4493 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 PKD1P98161 4303 aa-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 AKAP13Q12802 2813 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 RTL9Q8NET4 1388 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 A0A1W2PRE2 83 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 C17orf112F2Z3M2 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 FXYD1O00168 92 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 GPR31O00270 319 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 NDUFC2O95298 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 OR10J4P0C629 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 SLC25A4P12235 298 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 PDE6GP18545 87 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 RTL8BQ17RB0 113 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 Q5XG85 94 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 Q6ZQY7 126 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 FAM24BQ8N5W8 94 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 DIRC1Q969H9 104 aa-0.05□□□□□ -2.42
HECTD1-218ENST00000557695 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms