RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 TCL1AP56279 114 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 JMJD1CQ15652 2540 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM189A5PLL7 270 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 A8MWL6 223 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 OR11H12B2RN74 326 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF124Q15973 351 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 CT83Q5H943 113 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 PRR9Q5T870 116 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 TSKUQ8WUA8 353 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 ORM1P02763 201 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 HLA-DRB4P13762 266 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 CRISP2P16562 243 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 FAM210BQ96KR6 192 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 ODF3Q96PU9 254 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 RAB5AP20339 215 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TSPOP30536 169 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 BTF3L4Q96K17 158 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 XKRY2A2RUG3 117 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 H3BMM0 161 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 GZMBP10144 247 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 NEU1Q99519 415 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 SPINK4O60575 86 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 CD7P09564 240 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 FXYD7P58549 80 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01559Q495D7 138 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 STHQ8IWL8 128 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 C7orf71A4D174 169 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 HIGD1CA8MV81 97 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 KLLNB2CW77 178 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 M0R2Z0 102 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 IGLL1P15814 213 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 CDKN1BP46527 198 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 KIR3DS1Q14943 382 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 Q6AWC8 147 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 AMTNQ6UX39 209 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZQT7 251 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 NUP35Q8NFH5 326 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 NAGKQ9UJ70 344 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 MAST4O15021 2626 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 FAM231BA6NCW3 169 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 A8MTW9 85 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 GTSF1Q8WW33 167 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.93□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TYMSP04818 313 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TPPP3Q9BW30 176 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 MUC21Q5SSG8 566 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 BORCS7Q96B45 105 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRR-209ENST00000549308 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRR-209ENST00000549308 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
PTPRR-209ENST00000549308 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRR-209ENST00000549308 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRR-209ENST00000549308 AGRNO00468 2067 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRR-209ENST00000549308 ATRQ13535 2644 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms