RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	USP54	Q70EL1	1684 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		0.45	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	A2M	P01023	1474 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	IFITM5	A6NNB3	132 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		C9JAW5	83 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		J3QR89	54 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		M0QZK8	103 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	YPEL1	O60688	119 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TNFSF15	O95150	251 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HBD	P02042	147 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CRYGS	P22914	178 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	KDELR1	P24390	212 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ARPC4	P59998	168 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MAX	P61244	160 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	BLCAP	P62952	87 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR8B8	Q15620	311 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MORN2	Q502X0	79 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MORN4	Q8NDC4	146 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	NAT14	Q8WUY8	206 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TECPR2	O15040	1411 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MED23	Q9ULK4	1368 aa		0.44	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0D9SG42	100 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0J9YY99	117 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF727	A8MUV8	499 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		K7EIL1	84 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		M0R2Z0	102 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SULT1C4	O75897	302 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR2H2	O95918	312 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HMGN1	P05114	100 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A4	P12235	298 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	EVI2A	P22794	236 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SDC4	P31431	198 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CKS2	P33552	79 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CKS1B	P61024	79 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	QRFP	P83859	136 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CASC2	Q6XLA1	102 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ATOH7	Q8N100	152 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf111	Q8N326	155 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TEX29	Q8N6K0	151 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	BRK1	Q8WUW1	75 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PFDN5	Q99471	154 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	NABP2	Q9BQ15	211 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	VPS25	Q9BRG1	176 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SAR1A	Q9NR31	198 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	COPZ2	Q9P299	210 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		0.43	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MUC4	Q99102	2169 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1W2PPB8	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1W2PRS3	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ARPC5	O15511	151 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	IGHV3-30	P01768	117 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	RBP4	P02753	201 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	GYPB	P06028	91 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MPC1L	P0DKB6	136 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	COX4I1	P13073	169 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CCL4	P13236	92 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HLA-DRB4	P13762	266 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	FXYD4	P59646	89 aa		0.42	□□□□□ -2.34

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