RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 C1orf185Q5T7R7 199 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 GUSBP11Q6P575 273 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 FA2HQ7L5A8 372 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 ERASQ7Z444 233 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 MTURNQ8N3F0 131 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 ZADH2Q8N4Q0 377 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 UBALD1Q8TB05 177 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 MRAPQ8TCY5 172 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 TRGV9Q99603 122 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 SIGMAR1Q99720 223 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 ENY2Q9NPA8 101 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 PRO0461Q9UI25 63 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 USP34Q70CQ2 3546 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.65□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.65□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.65□□□□□ -1.82
TRDN-204ENST00000542443 TNCP24821 2201 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GUT8 65 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 P01737 135 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 TCRAP04437 139 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 EVI2AP22794 236 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 COL8A2P25067 703 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 MPV17P39210 176 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 CYB561P49447 251 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 ZNF137PP52743 207 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 RIPPLY3P57055 190 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 MOB3BQ86TA1 216 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 Q86TA4 180 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 LINC00311Q8N616 119 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 LINC01600Q96MT4 127 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 CNFNQ9BYD5 112 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 OTORQ9NRC9 128 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 PRR34Q9NV39 138 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 CALYQ9NYX4 217 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 B4GALT7Q9UBV7 327 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 PI4KAP42356 2102 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 MYO9BQ13459 2157 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 ATRXP46100 2492 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 CHD6Q8TD26 2715 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 H3BUT2 72 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 J3QR89 54 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN13O95857 204 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 NCR2O95944 276 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 FABP2P12104 132 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 OTX2P32243 289 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 PDPNQ86YL7 162 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 GNG12Q9UBI6 72 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 Q9UF83 564 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PRD5 423 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PRF3 423 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PRM7 423 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 FAM168BA1KXE4 195 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 PGPA6NDG6 321 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 K7EM74 188 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 M0QXV9 152 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 COX7A2P2O60397 106 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 HBDP02042 147 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-204ENST00000542443 SMIM13P0DJ93 91 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.5 ms