RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533039.2

SOX9-AS1-210, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene SOX9-AS1, Length 426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-210ENST00000533039 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.09□□□□□ -1.43
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A1W2PPV4 95 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TNP2Q05952 138 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF415Q09FC8 603 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q8TAT8 98 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q9H3A6 140 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MBD2Q9UBB5 411 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.08□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PAX4O43316 350 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPINK4O60575 86 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLAQ13239 276 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ESRGQ1W209 222 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PRR9Q5T870 116 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UPK3BQ9BT76 320 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MUC4Q99102 2169 aa6.07□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A096LPF7 62 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A1W2PPQ1 181 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PGPA6NDG6 321 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C16orf90A8MZG2 172 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DIRC3C9JPN6 131 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF266Q14584 549 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MUC21Q5SSG8 566 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF575Q86XF7 245 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HYLS1Q96M11 299 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BATF3Q9NR55 127 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OTORQ9NRC9 128 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PRO0255Q9UI72 69 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.06□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV3-53P01767 116 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q6AWC8 147 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q6ZQT7 251 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMED6Q8WW62 240 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SPXQ9BT56 116 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SIVA1O15304 175 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CRYBA4P53673 196 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NAGKQ9UJ70 344 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ALG5Q9Y673 324 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 K7EQM0 130 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PTTG1O95997 202 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RAB2AP61019 212 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C8orf49Q96NF6 230 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MED28Q9H204 178 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 WFDC1Q9HC57 220 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MDFICQ9P1T7 246 aa6.03□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 J3QL48 77 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NXPH4O95158 308 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MBP02144 154 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ORM1P02763 201 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SRIP30626 198 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FHL2Q14192 279 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TDRG1Q3Y452 100 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RASL10AQ92737 203 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KCNS1Q96KK3 526 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TREM1Q9NP99 234 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.01□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.01□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.01□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-210ENST00000533039 F6UZH7 168 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms