RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531318.1

NFRKB-208, Transcript of nuclear factor related to kappaB binding protein, human

TSL 4

Gene NFRKB, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFRKB-208	ENST00000531318	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318		H3BMQ9	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318		L7N2F9	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	LECT2	O14960	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	TSC22D2	O75157	780 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	CST7	O76096	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	VAMP2	P63027	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	RAB31	Q13636	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318		Q8TAT8	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	PFDN5	Q99471	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318		C9JCJ5	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318		K7EP13	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	CCS	O14618	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF253	O75346	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	NDUFB4	O95168	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	ORM1	P02763	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	CRISP2	P16562	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	S100A5	P33763	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	INPP1	P49441	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	BAX	Q07812	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	FGF7	P21781	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	CAV2	P51636	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	TAS2R30	P59541	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	WFDC2	Q14508	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF138	P52744	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	C1QB	P02746	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	NMB	P08949	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	OR10J4	P0C629	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	PDE6H	Q13956	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RASL10A	Q92737	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SPX	Q9BT56	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318		V9GYH0	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318		M0R2P5	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GNRH2	O43555	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	NDUFB6	O95139	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	CSN1S1	P47710	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	S100A10	P60903	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	BAK1	Q16611	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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