RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CA2P00918 260 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1D-33P01593 117 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1-33P01594 117 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 REG1AP05451 166 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 CD24P25063 80 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 ATP6V0CP27449 155 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF138P52744 262 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 PRR4Q16378 134 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 C2orf83Q53S99 150 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 GGACTQ9BVM4 153 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NOTCH2Q04721 2471 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 FNDC10F2Z333 226 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF253O75346 499 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 RUNX1Q01196 453 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 KLK9Q2XQG4 91 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 Q8N9W7 124 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 FMC1Q96HJ9 113 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 HIVEP1P15822 2718 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IFNA10P01566 189 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 HLA-DRB1P01911 266 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NPY1RP25929 384 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
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PTPRC-214ENST00000530727 SERF2P84101 59 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NDPQ00604 133 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 PMVKQ15126 192 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 MMDQ15546 238 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 GUCA2BQ16661 112 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM97Q5BJF2 176 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 WFDC11Q8NEX6 87 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SIGMAR1Q99720 223 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 Q9H3A6 140 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 PARP11Q9NR21 331 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 UQCC1Q9NVA1 299 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 UMAD1C9J7I0 102 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV12-3P01733 135 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 CHTF8P0CG12 524 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 OR13C7P0DN81 318 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 BRS3P32247 399 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 ERHP84090 104 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF493Q6ZR52 646 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM86BQ8N661 226 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 MGST2Q99735 147 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NPCDR1Q9BY65 106 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A22Q9H936 323 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 GNB4Q9HAV0 340 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NPVFQ9HCQ7 196 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 RPRMQ9NS64 109 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 MTORP42345 2549 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 A6NDX4 124 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 C8orf87E5RJ46 101 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 I3L2K1 104 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 YIF1AO95070 293 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 IFNA4P05014 189 aa2.99□□□□□ -1.93
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PTPRC-214ENST00000530727 SNCAP37840 140 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 CTRLP40313 264 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 OPRK1P41145 380 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 CXCL6P80162 114 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 HES1Q14469 280 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRC-214ENST00000530727 FXYD3Q14802 87 aa2.99□□□□□ -1.93
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