RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRK-218ENST00000525459 TMEM250H0YL14 139 aa13.56□□□□□ -0.24
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
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PTPRK-218ENST00000525459 LYRM9A8MSI8 78 aa13.44□□□□□ -0.26
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PTPRK-218ENST00000525459 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.43□□□□□ -0.26
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PTPRK-218ENST00000525459 AZU1P20160 251 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRK-218ENST00000525459 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRK-218ENST00000525459 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB4AO15263 64 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-218ENST00000525459 SH2D1AO60880 128 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRK-218ENST00000525459 CEBPGP53567 150 aa13.42□□□□□ -0.26
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