RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLQO75417 2590 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGF2P01344 180 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 FXYD3Q14802 87 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIQKQ629K1 86 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 STX12Q86Y82 276 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 MORN4Q8NDC4 146 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 MPC1Q9Y5U8 109 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PPB8 328 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PRS3 328 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL5CA6NH57 179 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIR3DP1A8MWS1 328 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 G0S2P27469 103 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNG10P50151 68 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPINK6Q6UWN8 80 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 C5orf56Q8N8D9 126 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 C19orf12Q9NSK7 152 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 TANC2Q9HCD6 1990 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 KDM6BO15054 1643 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PRE2 83 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 BBIP1A8MTZ0 92 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRP9P49458 86 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJB13P59910 316 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 ESPL1Q14674 2120 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00305Q7Z4B0 112 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM229BQ8NBD8 167 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 THEM6Q8WUY1 208 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00208Q96KT6 92 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC32Q9BV29 185 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCBD2Q9H0N5 130 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 FKBP11Q9NYL4 201 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 MED31Q9Y3C7 131 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRPM7Q96QT4 1865 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGF2RP11717 2491 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFITM5A6NNB3 132 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 E7EQ34 232 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM107AO95990 144 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 TEX29Q8N6K0 151 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR51A4Q8NGJ6 313 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATPIF1Q9UII2 106 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 RREB1Q92766 1687 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 PFDN1O60925 122 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAT14Q8WUY8 206 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 LXNQ9BS40 222 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMPXQ9UHP9 88 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPRGP23470 1445 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 A2MP01023 1474 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 PBRM1Q86U86 1689 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLEC1Q9Y238 1755 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPAG17Q6Q759 2223 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIGD1CA8MV81 97 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 H3BMG7 143 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDF1O60869 148 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC25A4P12235 298 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYH1P12882 1939 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRYGSP22914 178 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF56Q15929 161 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL17AQ8IVW1 177 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 NINQ8N4C6 2090 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR8J3Q8NGG0 315 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 DMAC1Q96GE9 116 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 CBLN4Q9NTU7 201 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 COMMD3Q9UBI1 195 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCA1O95477 2261 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRP5O75197 1615 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A096LNT2 108 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 TPST1O60507 370 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 ETV6P41212 452 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-377P-201ENST00000515965 BLCAPP62952 87 aa-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms