RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515005.1

SMAD5-210, Transcript of SMAD family member 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD5, Length 368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-210ENST00000515005 GAGE5Q13069 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 RAB31Q13636 194 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 GUK1Q16774 197 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 GAGE13Q4V321 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 FAM231BA6NCW3 169 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 GNRH2O43555 120 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 TBPP20226 339 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMAD5-210ENST00000515005 AQP4P55087 323 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 Q0VG73 95 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMAD5-210ENST00000515005 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 ENHOQ6UWT2 76 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMAD5-210ENST00000515005 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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SMAD5-210ENST00000515005 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 Q9UF83 564 aa7.29□□□□□ -1.24
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SMAD5-210ENST00000515005 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 A0A087WX48 190 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 SYNGR2O43760 224 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 MED6O75586 246 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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SMAD5-210ENST00000515005 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD5-210ENST00000515005 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.28□□□□□ -1.24
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SMAD5-210ENST00000515005 TAS2R19P59542 299 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD5-210ENST00000515005 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD5-210ENST00000515005 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.25□□□□□ -1.25
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SMAD5-210ENST00000515005 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.24□□□□□ -1.25
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SMAD5-210ENST00000515005 hDV102S1A0JD36 115 aa7.23□□□□□ -1.25
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SMAD5-210ENST00000515005 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 CNBD2Q96M20 576 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 TCRBP04435 133 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 PYYP10082 97 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD5-210ENST00000515005 SLC25A6P12236 298 aa7.22□□□□□ -1.25
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SMAD5-210ENST00000515005 GABARAPL2P60520 117 aa7.22□□□□□ -1.25
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