RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500576.4

LYRM4-208, Transcript of LYR motif containing 4, human

TSL 2 BASIC

Gene LYRM4, Length 592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM4-208	ENST00000500576	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	RELN	P78509	3460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	RHOG	P84095	191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	RIG	Q13278	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576		Q56UQ5	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LYRM4-208	ENST00000500576	FLNC	Q14315	2725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CHEK1	O14757	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CSN1S1	P47710	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	AMT	P48728	403 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CFHR3	Q02985	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	LRBA	P50851	2863 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CR1	P17927	2039 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	C20orf202	A1L168	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576		G3V318	75 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	SH2D1A	O60880	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	MSMB	P08118	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	LINC00614	P0C842	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	RNF224	P0DH78	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	BMI1	P35226	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CAMP	P49913	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576		S4R3C0	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	NDUFA4	O00483	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	SOCS3	O14543	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	HSBP1	O75506	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	GPR183	P32249	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	VGLL1	Q99990	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576		A0A096LNJ9	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576		M0R143	59 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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