RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	LTBP2	Q14767	1821 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLCE1	Q9P212	2302 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SDK2	Q58EX2	2172 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL8	P80075	99 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF182	Q8N6D2	247 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01565	O15544	149 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PFN2	P35080	140 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PATE2	Q6UY27	113 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	METTL26	Q96S19	204 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		J3QQQ9	107 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	DTX2	Q86UW9	622 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	THAP8	Q8NA92	274 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ODF3	Q96PU9	254 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNTFR	P26992	372 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	DSCR8	Q96T75	97 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf97	H3BN30	126 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIEZO1	Q92508	2521 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMO7DN	F2Z398	122 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF152	Q8N8N0	203 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	GP9	P14770	177 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL5	P42830	114 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PROK2	Q9HC23	129 aa		6.43	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R381	172 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERP2	Q8N6R1	65 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF125	Q96EQ8	232 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00477	Q96M19	166 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR25	Q96S07	402 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-33	P01772	117 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TFF1	P04155	84 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYCNOS	P40205	109 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDE6H	Q13956	83 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf26	Q17RF5	130 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPRN	Q5BIV9	151 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf159	Q96HA4	380 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYGA	P11844	174 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABCA1	O95477	2261 aa		6.42	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0J9YY99	117 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0U1RQV1	116 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYGB	P07316	175 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFAP54	Q96N23	3096 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	OVOL1	O14753	267 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EM74	188 aa		6.41	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms