RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494977.1

FGD4-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 2

Gene FGD4, Length 2,349 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-208	ENST00000494977	PRR25	Q96S07	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		A0A1W2PQU0	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	GP9	P14770	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PLGLA	Q15195	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	LRP4	O75096	1905 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		A0A1W2PPC4	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TRIAP1	O43715	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	MLANA	Q16655	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	LYZL6	O75951	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CRIP1	P50238	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	KNTC1	P50748	2209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		A0A1W2PP55	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	LST1	O00453	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TIRAP	P58753	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	RHOH	Q15669	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		M0R3E3	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PROP1	O75360	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CCL14	Q16627	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	RETN	Q9HD89	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SH2D1A	O60880	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CDSN	Q15517	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		Q6ZS46	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	DAND5	Q8N907	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977		H3BTX0	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	PSPN	O60542	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	DLX1	P56177	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FGD4-208	ENST00000494977	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.84	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	CXCL13	O43927	109 aa		4.84	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.84	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	CD164	Q04900	197 aa		4.84	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	IGHG2	P01859	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	CD40	P25942	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	GFER	P55789	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	FHL2	Q14192	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FGD4-208	ENST00000494977	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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