RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 Q71RC1 249 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 IGFBPL1Q8WX77 278 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 C17orf77Q96MU5 243 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 CCL19Q99731 98 aa12.92□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.91□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 TACC2O95359 2948 aa12.91□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.91□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 PRR25Q96S07 402 aa12.91□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 LRRK2Q5S007 2527 aa12.91□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 PRSS47A8MTI9 375 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 PLXNB1O43157 2135 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 IGHV4-39P01824 125 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 LCNL1Q6ZST4 164 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 TTC9CQ8N5M4 171 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 NPIPB5A8MRT5 1133 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 LY6LH3BQJ8 138 aa12.9□□□□□ -0.34
SYP-208ENST00000494396 K7EIM0 57 aa12.9□□□□□ -0.34
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SYP-208ENST00000494396 A0A1B0GWB2 263 aa12.89□□□□□ -0.35
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SYP-208ENST00000494396 PLNP26678 52 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 GAGE13Q4V321 117 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 TM4SF20Q53R12 229 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 RPEQ96AT9 228 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 RNF185Q96GF1 192 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 TNFRSF6BO95407 300 aa12.89□□□□□ -0.35
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SYP-208ENST00000494396 PRTN3P24158 256 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa12.89□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 M0R3E3 92 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 CNTFRP26992 372 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 C12orf74Q32Q52 190 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.88□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 SCGB2A1O75556 95 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 WFDC2Q14508 124 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 C18orf15Q96N68 181 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 TCTAP57738 103 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 FXYD7P58549 80 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 RRN3P1Q2M238 152 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 MYOZ3Q8TDC0 251 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 MRAP2Q96G30 205 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 FOXC2Q99958 501 aa12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 K7ERJ3 54 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 LMO4P61968 165 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 VCX2Q9H322 139 aa12.86□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 SMKR1H3BMG3 65 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 APELAP0DMC3 54 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 COX6B1P14854 86 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 CKS1BP61024 79 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 SCGB2A2Q13296 93 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 DPM3Q9P2X0 92 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 PRO0461Q9UI25 63 aa12.85□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 A0A087WX48 190 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 PIMREGQ9BSJ6 248 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 FBXL15Q9H469 300 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 ODF3BA8MYP8 253 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 H3BMG7 143 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 MFAP4P55083 255 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 ATP5J2P56134 94 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 KLRD1Q13241 179 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 ETDBQ3ZM63 59 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 HIST1H4GQ99525 98 aa12.84□□□□□ -0.35
SYP-208ENST00000494396 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
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SYP-208ENST00000494396 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 TIMM23O14925 209 aa12.83□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 CNIH1O95406 144 aa12.83□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 SPG11Q96JI7 2443 aa12.83□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 RAB9AP51151 201 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 LAGE3Q14657 143 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 ASCL2Q99929 193 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 A6NJY4 79 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 IL17RELQ6ZVW7 336 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 SIRPDQ9H106 197 aa12.82□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.81□□□□□ -0.36
SYP-208ENST00000494396 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.81□□□□□ -0.36
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