RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 OR11H1Q8NG94 326 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 OR11H2Q8NH07 326 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TSKUQ8WUA8 353 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 PTPN13Q12923 2485 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C9orf118A6NHY6 69 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 LINC01548A6NM66 108 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 P01737 135 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 G3V318 75 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DRB1P01911 266 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 FAM106CPP0CH98 169 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 Q8N9W7 124 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 OTORQ9NRC9 128 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 VPS13CQ709C8 3753 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 APCP25054 2843 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 FAM181BA6NEQ2 426 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 H3BRN7 92 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DQA1P01909 254 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 MT-ND6P03923 174 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 MLST8Q9BVC4 326 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TPPP3Q9BW30 176 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 F8W735 103 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN13O95857 204 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SEC11AP67812 179 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 Q86TA4 180 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 Q8N6K4 173 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 FMC1Q96HJ9 113 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V0E1O15342 81 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 LTAP01374 205 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 UBE2E1P51965 193 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 KIR3DS1Q14943 382 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ETDBQ3ZM63 59 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 COX19Q49B96 90 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 GTSF1Q8WW33 167 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 C15orf32Q32M92 178 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.43□□□□□ -1.54
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HERC4-211ENST00000492996 C1RLQ9NZP8 487 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 ZFHX3Q15911 3703 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CREBBPQ92793 2442 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 A8MWL6 223 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 OOSP1A8MZH6 123 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGLV2-11P01706 119 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CTSGP08311 255 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 NRGNQ92686 78 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 H3BRM9 83 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 NPFFO15130 113 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DMBP28068 263 aa5.42□□□□□ -1.54
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