RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 COLCA2A8K830 154 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 SH2D1AO60880 128 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 P01737 135 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 PRR9Q5T870 116 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 AMTNQ6UX39 209 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 C3orf56Q8N813 242 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 FAM231BA6NCW3 169 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 H3BMM0 161 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 Q6AWC8 147 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 OR11H12B2RN74 326 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 CD33P20138 364 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 S100PP25815 95 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 LEPP41159 167 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 LINC01559Q495D7 138 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 TSKUQ8WUA8 353 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 TYMSP04818 313 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 CXCL1P09341 107 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 BTF3L4Q96K17 158 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 KNCNA6PVL3 124 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 A8MWL6 223 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 TSPOP30536 169 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 CDKN1BP46527 198 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF124Q15973 351 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF575Q86XF7 245 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 NEU1Q99519 415 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 VWFP04275 2813 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1W2PPQ1 181 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 GPX1P07203 203 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 CD7P09564 240 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 GTSF1Q8WW33 167 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 AGRNO00468 2067 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 XKRY2A2RUG3 117 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 C7orf71A4D174 169 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM189A5PLL7 270 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 HIGD1CA8MV81 97 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 IGLC6P0CF74 106 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 RAB5AP20339 215 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 KIR3DS1Q14943 382 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 FAM210BQ96KR6 192 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 IGLL1P15814 213 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 CTRLP40313 264 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 TDRG1Q3Y452 100 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 PRR31Q5SQ13 230 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 DNLZQ5SXM8 178 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 NUP35Q8NFH5 326 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1B0GXF2 115 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 M0R2Z0 102 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV3-20P01619 116 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 AMBPP02760 352 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 ORM1P02763 201 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 TCL1AP56279 114 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 RASL11AQ6T310 242 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZQT7 251 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 STHQ8IWL8 128 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 CNFNQ9BYD5 112 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 STAB1Q9NY15 2570 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 SORL1Q92673 2214 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 J3KRW8 73 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 MED14OSP0DP75 135 aa8.43□□□□□ -1.06
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