RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-0.75□□□□□ -2.53
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SENP6-210ENST00000487548 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
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SENP6-210ENST00000487548 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 A0A0D9SFI3 127 aa-0.76□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 A0A0G2JMM0 328 aa-0.76□□□□□ -2.53
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SENP6-210ENST00000487548 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.76□□□□□ -2.53
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SENP6-210ENST00000487548 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.8□□□□□ -2.54
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SENP6-210ENST00000487548 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.8□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 NCAPD3P42695 1498 aa-0.8□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 HIGD1CA8MV81 97 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 NIPSNAP2O75323 286 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 ATP5HO75947 161 aa-0.81□□□□□ -2.54
SENP6-210ENST00000487548 IGF2P01344 180 aa-0.81□□□□□ -2.54
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