RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 XKRY2A2RUG3 117 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM189A5PLL7 270 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-DQA1P01909 254 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB4BP61018 213 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 DCANP1Q8TF63 244 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00477Q96M19 166 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 PEMTQ9UBM1 199 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.83□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GXF2 115 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 GZMBP10144 247 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 CD28P10747 220 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXA5P20719 270 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 HBBP68871 147 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6AWC8 147 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.82□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 K7EQG2 157 aa7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX3Q96PT4 197 aa7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PRX2 142 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 HAX1O00165 279 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 APCSP02743 223 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TFPI2P48307 235 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 AKR1D1P51857 326 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 PAFAH1B2P68402 229 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 RIGQ13278 110 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 BORCS7Q96B45 105 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 RAX2Q96IS3 184 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF114Q9Y508 228 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.8□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GUT8 65 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GW15 77 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL24O00175 119 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ORM1P02763 201 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A8P05109 93 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 CSN3P07498 182 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF688P0C7X2 276 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMPP49913 170 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 FHL3Q13643 280 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01559Q495D7 138 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMG4Q5JS54 123 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.79□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 F6UB75 175 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 CRISP2P16562 243 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 CTRLP40313 264 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 PROK1P58294 105 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB1P60022 68 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 TPPP3Q9BW30 176 aa7.78□□□□□ -1.16
GTPBP1-211ENST00000487538 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLC6P0CF74 106 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A2P29034 98 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 SLAQ13239 276 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR9Q5T870 116 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 GATD1Q8NB37 220 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 ODF3Q96PU9 254 aa7.77□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0J9YX75 114 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 IFITM10A6NMD0 228 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 GPX1P07203 203 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 LEPP41159 167 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 Q0VG73 95 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.76□□□□□ -1.17
GTPBP1-211ENST00000487538 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms