RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 NRGNQ92686 78 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 PRELID3AQ96N28 172 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 CENPEQ02224 2701 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 D6R8Y8 96 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 FA2HQ7L5A8 372 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 TPPP3Q9BW30 176 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 ST20Q9HBF5 79 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 TACC2O95359 2948 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 OVOL1O14753 267 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01545Q5VT33 79 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 AMN1Q8IY45 258 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 LY6EQ16553 131 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 C16orf92Q96LL3 132 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 FSHBP01225 129 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV12-3P01733 135 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 BLCAPP62952 87 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 C20orf173Q96LM9 149 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 FOXE3Q13461 319 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 MAJINQ3KP22 176 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 KLK15Q9H2R5 256 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 TCF21O43680 179 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 CSN3P07498 182 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRF-212ENST00000477970 PF4V1P10720 104 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZN92 141 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 TSPOP30536 169 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 ATOH7Q8N100 152 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF738Q8NE65 137 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZS46 218 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 SMPXQ9UHP9 88 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRF-212ENST00000477970 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 MAST4O15021 2626 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRF-212ENST00000477970 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.25□□□□□ -0.93
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