RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 C17orf77Q96MU5 243 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 WISP2O76076 250 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 CD3EP07766 207 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 GP9P14770 177 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC25A16P16260 332 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 LYPD2Q6UXB3 125 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.38□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM106CPP0CH98 169 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 CFAP54Q96N23 3096 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 LHBP01229 141 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 CGB3P0DN86 165 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 CGB7P0DN87 165 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 USP34Q70CQ2 3546 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 GATA4P43694 442 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 TEN1Q86WV5 123 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 EFNA4P52798 201 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 KIR2DL4Q99706 377 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 MLST8Q9BVC4 326 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 BSPH1Q075Z2 132 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 NPC2P61916 151 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 TCF15Q12870 199 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 PMVKQ15126 192 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM101Q96IK0 257 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.35□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 TAL2Q16559 108 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 LINC01559Q495D7 138 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 SORL1Q92673 2214 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 ATXN8Q156A1 80 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 DSCAMO60469 2012 aa11.34□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.33□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM178BH3BS89 294 aa11.33□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.33□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 RITA1Q96K30 269 aa11.33□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.33□□□□□ -0.59
SH3BP5L-202ENST00000475978 ADAMTS20P59510 1910 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 H3BMM0 161 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 UBE2WQ96B02 151 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 FGF6P10767 208 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 LYNX1P0DP58 116 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 C16orf92Q96LL3 132 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPATA25Q9BR10 227 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 REV3LO60673 3130 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 E9PLD3 99 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 TIMM23O14925 209 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPRY4Q9C004 299 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 XGP55808 180 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIGD1BQ9P298 99 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A0U1RRA0 63 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 MYCNOSP40205 109 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP5L-202ENST00000475978 NBR2O15453 112 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms