RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01559Q495D7 138 aa10.5□□□□□ -0.73
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SH3BP1-206ENST00000469947 RNF182Q8N6D2 247 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 HIST1H4GQ99525 98 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHG4P01861 327 aa10.5□□□□□ -0.73
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SH3BP1-206ENST00000469947 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa10.5□□□□□ -0.73
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SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.46□□□□□ -0.73
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SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.43□□□□□ -0.74
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SH3BP1-206ENST00000469947 CTSGP08311 255 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 NRACQ8N912 160 aa10.42□□□□□ -0.74
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SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 CDIP1Q9H305 208 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXI1Q12951 378 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10.41□□□□□ -0.74
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SH3BP1-206ENST00000469947 PTH2Q96A98 100 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01548A6NM66 108 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 OR11H12B2RN74 326 aa10.4□□□□□ -0.74
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 SYT8Q8NBV8 401 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 OR11H1Q8NG94 326 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 OR11H2Q8NH07 326 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF5Q99942 180 aa10.4□□□□□ -0.74
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SH3BP1-206ENST00000469947 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.4□□□□□ -0.74
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