RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TMEM89A2RUT3 159 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ATP5LO75964 103 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 CSN3P07498 182 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 COX8AP10176 69 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 G0S2P27469 103 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 SEC11AP67812 179 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 NRGNQ92686 78 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 CCDC140Q96MF4 163 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 VGLL1Q99990 258 aa6.56□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 K7EMT4 169 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 CD5LO43866 347 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGHG2P01859 326 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 FCER1GP30273 86 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 AMN1Q8IY45 258 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ATOH7Q8N100 152 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 STPG4Q8N801 248 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 MRAP2Q96G30 205 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 COX11Q9Y6N1 276 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 S4R3C0 116 aa6.55□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TMEM213A2RRL7 107 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 SNAI2O43623 268 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-23P01764 117 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4-39P01824 125 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TRGV3P03979 118 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ARL3P36405 182 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 UBE2V1Q13404 147 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 FOXE3Q13461 319 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 Q8N8P6 123 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 GLMPQ8WWB7 406 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 C16orf92Q96LL3 132 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 FOXC2Q99958 501 aa6.54□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ABCA1O95477 2261 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ABCA4P78363 2273 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 M0QZ24 198 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 NDUFS7O75251 213 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TNFRSF6BO95407 300 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DRB4P13762 266 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A16P16260 332 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ID1P41134 155 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 KIR3DS1Q14943 382 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 Q5PR19 223 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.53□□□□□ -1.36
ACTB-208ENST00000464611 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 A6NDN8 102 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 A6NDX4 124 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 B4DSR2 109 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 G3V318 75 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 J3QLI3 93 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 NUDT3O95989 172 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PTTG1IPP53801 180 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 MAJINQ3KP22 176 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 FBLN7Q53RD9 439 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 RNF185Q96GF1 192 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 C20orf78Q9BR46 151 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.52□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 A0A096LNJ9 63 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 hDV102S1A0JD36 115 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 M0R381 172 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 NPYP01303 97 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 MSMBP08118 114 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ERCC8Q13216 396 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 MPV17L2Q567V2 206 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 Q8TAT8 98 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ZMAT4Q9H898 229 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 HIGD1BQ9P298 99 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.51□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms