RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 MLST8Q9BVC4 326 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 XCL2Q9UBD3 114 aa6.89□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 F8W036 122 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 J3KRW8 73 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 GCGP01275 180 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 MRAPQ8TCY5 172 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf49Q96NF6 230 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ASCL2Q99929 193 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC11CQ9BY50 192 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NAT8Q9UHE5 227 aa6.88□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6AWC8 147 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZWC4 215 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 OCC1Q8TAD7 63 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 H7BYZ3 331 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV2-8P01709 118 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFA6Q01524 100 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 BTN1A1Q13410 526 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR3DS1Q14943 382 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR9Q5T870 116 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR27Q6MZM9 219 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01551Q86U37 167 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ADIRFQ15847 76 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 RCHY1Q96PM5 261 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01587Q99440 93 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EN84 100 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SH2D1AO60880 128 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ADCYAP1P18509 176 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CRIP1P50238 77 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5I1Q13606 314 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB135Q30KP9 77 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF183Q96D59 192 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNS1Q96KK3 526 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 XKRY2A2RUG3 117 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRY2O43597 315 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 P01737 135 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ORM1P02763 201 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ERVFC1-1P60608 527 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TDRG1Q3Y452 100 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 ISOC2Q96AB3 205 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 NEU1Q99519 415 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA25Q9BR10 227 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 OSTCQ9NRP0 149 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 NAGKQ9UJ70 344 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM189A5PLL7 270 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 CBY3A6NI87 242 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 B4DEV8 164 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R036 132 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R2P9O14990 202 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP4-208ENST00000462602 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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