RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461327.5

RRM2-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-204	ENST00000461327	HOXA5	P20719	270 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	TAS2R60	P59551	318 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ERCC8	Q13216	396 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.51	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327		G3V3Q6	166 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	SIVA1	O15304	175 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.5	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	OR10J4	P0C629	311 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.5	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	LRP2	P98164	4655 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327		H7BYZ3	331 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	LEP	P41159	167 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	VGLL1	Q99990	258 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	RNF222	A6NCQ9	220 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	KLLN	B2CW77	178 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	OR7C2	O60412	319 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	RAB2A	P61019	212 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327		J3KRW8	73 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	NXPH4	O95158	308 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	CRISP2	P16562	243 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	C16orf74	Q96GX8	76 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	TAS2R45	P59539	299 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	CD300C	Q08708	224 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF266	Q14584	549 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RRM2-204	ENST00000461327		A0A096LPF7	62 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	GAGE12B	A1L429	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	C7orf71	A4D174	169 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	GAGE7	O76087	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	OXT	P01178	125 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	GAGE12F	P0CL80	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	GAGE12G	P0CL81	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	GAGE12I	P0CL82	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	PRR9	Q5T870	116 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327		A0A1W2PPV4	95 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	NMB	P08949	121 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	BTN1A1	Q13410	526 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327		Q6ZQT7	251 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	NFE4	Q86UQ8	179 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	SERF2	P84101	59 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	SUN5	Q8TC36	379 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	GPX1	P07203	203 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	ZNF138	P52744	262 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	PGP	A6NDG6	321 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RRM2-204	ENST00000461327	ASIP	P42127	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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