RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 SCNM1Q9BWG6 230 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01619G3V211 115 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2D1P51668 147 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNG7P62955 275 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 DTX2Q86UW9 622 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 Q8N9W7 124 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LY6HO94772 140 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGF1P05019 195 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 VHLLQ6RSH7 139 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01600Q96MT4 127 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf118A6NHY6 69 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IL4P05112 153 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ETFRF1Q6IPR1 90 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CSTL1Q9H114 145 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SH2D1AO60880 128 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CT45A10P0DMU9 189 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NBR2O15453 112 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 APELAP0DMC3 54 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL17Q92583 94 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SPOCK3Q9BQ16 436 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ENY2Q9NPA8 101 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 BRI3O95415 125 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD7P58549 80 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 BORCS7Q96B45 105 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WW49 117 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 G3V4G9 280 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SMKR1H3BMG3 65 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BRM9 83 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CHEK1O14757 476 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYGDP07320 174 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM162BQ5T6X4 162 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 STAB1Q9NY15 2570 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HBDP02042 147 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM238C9JI98 176 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM17P0DL12 118 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LMO4P61968 165 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ORMDL3Q8N138 153 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB3O43676 98 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TRGV3P03979 118 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRG2O14669 202 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CSN3P07498 182 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 DPM3Q9P2X0 92 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 B9A039 149 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFL4Q6B9Z1 124 aa2.75□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RBAKDNA6NC62 111 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FCER1GP30273 86 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PRELID3AQ96N28 172 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD52Q0P140 79 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RASL10AQ92737 203 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM158Q8WZ71 300 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 LYZP61626 148 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ARF6P62330 175 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 S4R3C0 116 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PPM0 123 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF6BO95407 300 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 CSN1S1P47710 185 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5A1Q8NGJ0 315 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 VKORC1Q9BQB6 163 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB1BQ9H0U4 201 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RASL11BQ9BPW5 248 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 WFDC8Q8IUA0 241 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V0BQ99437 205 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 OOSP1A8MZH6 123 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR1DP28221 377 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 PRNTQ86SH4 94 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 NACAE9PAV3 2078 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JLM5 398 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
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