RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.68□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FOXC2Q99958 501 aa5.68□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PEMTQ9UBM1 199 aa5.68□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 U3KQK5 164 aa5.68□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FOXS1O43638 330 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAGEA5P43359 124 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DLX1P56177 255 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SYNJ2BPP57105 145 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM201AQ5SY85 155 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ORMDL3Q8N138 153 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 Q8N8P6 123 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LYZL4Q96KX0 146 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPEGQ15772 3267 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FRYQ5TBA9 3013 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LIFP15018 202 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLNP26678 52 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 Q6ZRU5 148 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MKXQ8IYA7 352 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CD177Q8N6Q3 437 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 COPS9Q8WXC6 57 aa5.67□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TEX22C9J3V5 150 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 D6R8Y8 96 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRR20EP86478 221 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRR20CP86479 221 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRR20DP86480 221 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRR20BP86481 221 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRR20AP86496 221 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PROK2Q9HC23 129 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KNCNA6PVL3 124 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WISP1O95388 367 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLAUP00749 431 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGLV2-14P01704 120 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.66□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C17orf100A8MU93 164 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 M0R135 149 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGKV1D-12P01611 117 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LOXL3P58215 753 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HILS1P60008 231 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRSS46E5RG02 174 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCL21O00585 134 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FHL2Q14192 279 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRR15Q8IV56 129 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C1orf159Q96HA4 380 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TMEM243Q9BU79 118 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RNF7Q9UBF6 113 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZZEF1O43149 2961 aa5.65□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 A0A0B4J2C4 111 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LINC01546A6NGU7 62 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGHV3-33P01772 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF329Q86UD4 541 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 Q9UF83 564 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 H7C423 109 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGHV4-39P01824 125 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRNPP04156 253 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPINK9Q5DT21 86 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF815PA8K554 130 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 OVOL3O00110 214 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FGF12P61328 243 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ERCC8Q13216 396 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF524Q96C55 264 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF799Q96GE5 643 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ITPR1Q14643 2758 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CD69Q07108 199 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.63□□□□□ -1.51
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LINC00596Q86U02 117 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms