RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf173Q96LM9 149 aa7.37□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 MT-ND6P03923 174 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 VWFP04275 2813 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GW15 77 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 OR4C46A6NHA9 309 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 CRISP2P16562 243 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 CRIP1P50238 77 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 ERCC8Q13216 396 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM189A5PLL7 270 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 SH2D1AO60880 128 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 S100A8P05109 93 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 EDN2P20800 178 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01559Q495D7 138 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 C8orf49Q96NF6 230 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 NEU1Q99519 415 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-202ENST00000409024 RYR3Q15413 4870 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0J9YX75 114 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PRX2 142 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 A8MTW9 85 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HIGD1CA8MV81 97 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DQA1P01909 254 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TSPOP30536 169 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 LEPP41159 167 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 NUP35Q8NFH5 326 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 Q8TAT8 98 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 DUX3Q96PT4 197 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 F2Z2F3 143 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 PHOX2AO14813 284 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TRGC2P03986 189 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF688P0C7X2 276 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 INSL3P51460 131 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 RIGQ13278 110 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 PSMG4Q5JS54 123 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 BORCS7Q96B45 105 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GXF2 115 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 KLLNB2CW77 178 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 S100A6P06703 90 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP10-3P60369 221 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HBBP68871 147 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 DNLZQ5SXM8 178 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 GATD1Q8NB37 220 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 GTSF1Q8WW33 167 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 CITED1Q99966 193 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GUT8 65 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV1-51P01701 117 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ORM1P02763 201 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 PF4P02776 101 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 GPX1P07203 203 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 MED14OSP0DP75 135 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DRB4P13762 266 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TFPI2P48307 235 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TCL1AP56279 114 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 CNFNQ9BYD5 112 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 SNURFLB1AK76 121 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 AMBPP02760 352 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 IGLC6P0CF74 106 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 CTRLP40313 264 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB131AP59861 70 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 FRZBQ92765 325 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 KCNS1Q96KK3 526 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR1A-202ENST00000409024 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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