RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa21.51■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 C8orf86Q6ZUL3 223 aa21.51■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 OR4X2Q8NGF9 303 aa21.51■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 WNK2Q9Y3S1 2297 aa21.51■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 A6NDN8 102 aa21.5■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 RBX1P62877 108 aa21.5■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 LINC01548A6NM66 108 aa21.49■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 ATP5G2Q06055 141 aa21.49■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 SMIM15Q7Z3B0 74 aa21.49■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 GAS8-AS1O95177 125 aa21.48■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 Q8N8P6 123 aa21.48■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 BPESC1Q9GZL8 116 aa21.48■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 C11orf21Q9P2W6 132 aa21.48■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 DKK2Q9UBU2 259 aa21.48■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 PPIFP30405 207 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 ZMAT4Q9H898 229 aa21.48■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 C18orf15Q96N68 181 aa21.47■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 EVI2AP22794 236 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 FAM223BA6NKX1 122 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 PRSS47A8MTI9 375 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 H3BRM9 83 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 ODF1Q14990 250 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 FAM223AQ8IWN6 122 aa21.46■■□□□ 1.03
UBP1-201ENST00000283628 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa21.45■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 CDKN1BP46527 198 aa21.45■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 WFDC3Q8IUB2 231 aa21.45■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 OR2K2Q8NGT1 345 aa21.45■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa21.44■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 NMUP48645 174 aa21.44■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 SMPXQ9UHP9 88 aa21.44■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 MOB4Q9Y3A3 225 aa21.44■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa21.44■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 LENEPQ9Y5L5 61 aa21.44■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 ATP5LO75964 103 aa21.43■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 C19orf54Q5BKX5 351 aa21.43■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa21.43■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 TRAV41A0A0B4J266 112 aa21.43■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 TRGV3P03979 118 aa21.42■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 C9orf139Q6ZV77 190 aa21.42■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 PCP2Q8IVA1 136 aa21.42■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 TMEM158Q8WZ71 300 aa21.42■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 CSMD1Q96PZ7 3565 aa21.42■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 C9orf118A6NHY6 69 aa21.41■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 PRSS1P07477 247 aa21.41■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 GLMPQ8WWB7 406 aa21.41■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 C16orf92Q96LL3 132 aa21.41■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 AP1S3Q96PC3 154 aa21.41■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 CST9LQ9H4G1 147 aa21.4■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 HHLA3Q9XRX5 114 aa21.4■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 IGKCP01834 107 aa21.4■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 TCTAP57738 103 aa21.4■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 NRACQ8N912 160 aa21.4■■□□□ 1.02
UBP1-201ENST00000283628 SPANXN1Q5VSR9 72 aa21.38■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 TMEM219Q86XT9 240 aa21.38■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 HIGD1BQ9P298 99 aa21.38■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 PCP4P48539 62 aa21.37■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 LAGE3Q14657 143 aa21.37■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 KIR3DS1Q14943 382 aa21.37■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 GAGE10A6NGK3 116 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 DPM2O94777 84 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 SMIM17P0DL12 118 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 FOXC2Q99958 501 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 UFC1Q9Y3C8 167 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 GAGE12BA1L429 117 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 ARL3P36405 182 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 MRAP2Q96G30 205 aa21.36■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 LINC00477Q96M19 166 aa21.35■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 HLA-DRB4P13762 266 aa21.35■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 OCIAD2Q56VL3 154 aa21.35■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa21.35■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 MYOZ3Q8TDC0 251 aa21.34■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa21.33■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 IGHV1-69P01742 117 aa21.33■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 UFSP1Q6NVU6 142 aa21.33■■□□□ 1.01
UBP1-201ENST00000283628 NDUFA4O00483 81 aa21.33■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 C20orf173Q96LM9 149 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 MED13LQ71F56 2210 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 A0A0G2JLM5 398 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 H3BVH4 76 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 OVOL1O14753 267 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 BRI3O95415 125 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 PRR9Q5T870 116 aa21.32■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa21.31■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 IGF1P05019 195 aa21.31■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 H3BUT2 72 aa21.3■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZQT7 251 aa21.3■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 OR10J6PQ8NGY7 276 aa21.3■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 MEGF9Q9H1U4 602 aa21.3■■□□□ 1
UBP1-201ENST00000283628 JMJD8Q96S16 334 aa21.3■■□□□ 1
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